一种双通道实时荧光定量PCR仪光路系统及检测方法，该光路系统包括双色光激发模块、微流控芯片模块、双通道荧光探测模块和图像处理模块；微流控芯片模块用于对待测样品扩增并采集荧光；双色光激发模块用于使待测样品出射荧光，并将激发光源出射的激发光与待测样品出射的荧光分离；双通道荧光探测模块用于实现不同波长荧光分通道传输,调整出射的不同波长荧光的光程。
本发明采用双通道激发待测样品荧光，单台图像捕获装置实现不同波长荧光实时同步成像，降低光路系统及整体仪器成本；光路系统设计简单、结构紧凑，减少光路系统中的光信号传输衰减，有利于整体仪器小型化、模块化；避免激发光和荧光之间的干扰，提高图像捕获装置接收信噪比和仪器检测灵敏度。

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本发明采用双通道激发待测样品荧光，单台图像捕获装置实现不同波长荧光实时同步成像，降低光路系统及整体仪器成本；光路系统设计简单、结构紧凑，减少光路系统中的光信号传输衰减，有利于整体仪器小型化、模块化；避免激发光和荧光之间的干扰，提高图像捕获装置接收信噪比和仪器检测灵敏度。