本发明公开了制备候选测序探针集的方法、装置及其应用,其中,制备候选测序探针集的方法包括:(1)基于参考基因组的目标mRNA序列设计探针,构建候选探针集合;(2)将候选探针集合与参考基因组的目标mRNA序列进行比对;(3)基于比对结果,对候选探针集合中的所有候选探针进行筛选;(4)针对参考基因组目标mRNA中的高度同源基因设计得到相同的探针;(5)合并特异性探针集和针对高度同源基因的探针。
利用该方法能够有效地获得针对参考基因组全部mRNA的候选测序探针集,进而,基于其能够有效制备获得转录组文库特异性测序引物组,利用该测序引物组进行转录组测序,测序结果及确定的转录本序列准确可靠、数据偏向性低。
徐讯 蒋慧 耿春雨 范广益 梁恩靖 祝珍珍
深圳华大基因研究院
518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼
本发明公开了制备候选测序探针集的方法、装置及其应用,其中,制备候选测序探针集的方法包括:(1)基于参考基因组的目标mRNA序列设计探针,构建候选探针集合;(2)将候选探针集合与参考基因组的目标mRNA序列进行比对;(3)基于比对结果,对候选探针集合中的所有候选探针进行筛选;(4)针对参考基因组目标mRNA中的高度同源基因设计得到相同的探针;(5)合并特异性探针集和针对高度同源基因的探针。
利用该方法能够有效地获得针对参考基因组全部mRNA的候选测序探针集,进而,基于其能够有效制备获得转录组文库特异性测序引物组,利用该测序引物组进行转录组测序,测序结果及确定的转录本序列准确可靠、数据偏向性低。