本发明提供了一种检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头及其制备方法,涉及基因工程技术领域,接头含有P5及P7引物序列,还包括a.测序引物位点SP序列;b.UMIs序列;c.样本标签Index序列。
P5端的3’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列,P7端的5’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列。
接头序列使用了独特设计的样本标签及UMIs序列位置,使其特别适用但不限于插入片段大小为100‑250bp的样本文库的构建,此外,双端UMIs大大提高了其对假阳性突变的识别能力,因而更加适用于低突变丰度样本的检测。
金泰庆 宋麒 万季 余涛 潘晓新 王志强 蔡雪儿 王一杏 关建洪 王奕
深圳市新合生物医疗科技有限公司
518000 广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层
本发明提供了一种检测低突变丰度样本的NGS文库制备接头及其制备方法,涉及基因工程技术领域,接头含有P5及P7引物序列,还包括a.测序引物位点SP序列;b.UMIs序列;c.样本标签Index序列。
P5端的3’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列,P7端的5’端依次连接测序引物位点SP序列、连接在一起的UMIs序列和样本标签Index序列。
接头序列使用了独特设计的样本标签及UMIs序列位置,使其特别适用但不限于插入片段大小为100‑250bp的样本文库的构建,此外,双端UMIs大大提高了其对假阳性突变的识别能力,因而更加适用于低突变丰度样本的检测。