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一种分子动力学模拟系统及方法

申请号: CN202410154209.7
申请人: 浪潮电子信息产业股份有限公司
申请日期: 2024/2/4

摘要文本

本发明公开了一种分子动力学模拟系统及方法,涉及数据处理领域,为解决分子动力学模拟系统数据传输效率低的问题,该分子动力学模拟系统包括:计算高速链路交换模块,及与计算高速链路交换模块连接的第一共享内存、全域处理板卡组、区域处理板卡组和信息计算板卡组。本发明中,当主机、全域处理板卡组、区域处理板卡组和信息计算板卡组通过计算高速链路与第一共享内存互联后,均可访问第一共享内存中的数据,无需主机端进行数据转发,提升计算任务处理效率,从而提升了分子动力学模拟的效率。

专利详细信息

项目 内容
专利名称 一种分子动力学模拟系统及方法
专利类型 发明申请
申请号 CN202410154209.7
申请日 2024/2/4
公告号 CN117690502A
公开日 2024/3/12
IPC主分类号 G16C10/00
权利人 浪潮电子信息产业股份有限公司
发明人 刘伟; 李仁刚; 徐亚明; 郭巍; 邓子为; 张德闪; 牟奇
地址 山东省济南市高新区浪潮路1036号

专利主权项内容

1.一种分子动力学模拟系统,其特征在于,包括:计算高速链路交换模块;第一共享内存,与所述计算高速链路交换模块连接,以便所述计算高速链路交换模块上连接的全域处理板卡组、区域处理板卡组和信息计算板卡组对所述第一共享内存进行访问;所述全域处理板卡组,用于当接收到中央处理器下发的计算任务,从所述第一共享内存中获取最新的时间片,基于所述最新的时间片中的全部粒子的信息计算各所述粒子受到的第一力值,将所述第一力值写入所述第一共享内存;所述区域处理板卡组,所述区域处理板卡组包括多张区域计算板卡,每一所述区域计算板卡用于当接收到所述计算任务,从所述第一共享内存中获取最新的时间片,基于所述最新的时间片中与自身对应的粒子的信息计算与自身对应的粒子受到的第二力值,将所述第二力值写入所述第一共享内存;所述信息计算板卡组,用于从所述第一共享内存中获取各个所述粒子的第一力值和第二力值,根据每一所述粒子的第一力值和第二力值在所述第一共享内存中更新每一所述粒子的信息。