一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合及其应用
摘要文本
本发明提供了一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合及其应用，涉及分子生物学、种质资源学和分子育种技术领域。本发明从290份卤虫资源简化测序产生的53万个SNP标记中筛选设计出13个卤虫核心标记。利用该套标记组合可以应用于构建卤虫SNP指纹图谱，检测卤虫品种的真实性，保证卤虫资源收集的可靠性，可以进行卤虫资源亲缘关系分析，并指导卤虫育种工作。所选择的13个核心SNP标记具有很高的遗传多样性，且稳定性好具有较好的可重复性，有很好的可利用性和推广价值。
申请人信息
- 申请人:渤海水产股份有限公司; 天津科技大学
- 申请人地址:251907 山东省滨州市北海经济开发区疏港路1号
- 发明人: 渤海水产股份有限公司; 天津科技大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合及其应用 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202410014639.9 |
| 申请日 | 2024/1/2 |
| 公告号 | CN117821611A |
| 公开日 | 2024/4/5 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6888 |
| 权利人 | 渤海水产股份有限公司; 天津科技大学 |
| 发明人 | 武心华; 韩学凯; 李科; 隋丽英; 张波; 孙荣松; 马红胜; 李自英 |
| 地址 | 山东省滨州市北海经济开发区疏港路1号; 天津市河西区大沽南路1038号 |
专利主权项内容
1.一种基于KASP的卤虫核心分子标记组合，其特征在于，由13个SNP分子标记组成；所述13个SNP分子标记分别为Artemia SNP01、Artemia SNP02、Artemia SNP03、ArtemiaSNP04、Artemia SNP05、Artemia SNP06、Artemia SNP07、Artemia SNP08、Artemia SNP09、Artemia SNP10、Artemia SNP11、Artemia SNP12和Artemia SNP13；所述Artemia SNP01位于卤虫的contig14上，物理位置为585775，参考碱基为C，替代碱基为A；所述Artemia SNP02位于卤虫的contig30上，物理位置为3557862，参考碱基为T，替代碱基为C；所述Artemia SNP03位于卤虫的contig71上，物理位置为1303074，参考碱基为A，替代碱基为T；所述Artemia SNP04位于卤虫的contig96上，物理位置为4160684，参考碱基为C，替代碱基为G；所述Artemia SNP05位于卤虫的contig210上，物理位置为3460211，参考碱基为G，替代碱基为A；所述Artemia SNP06位于卤虫的contig316上，物理位置为451626，参考碱基为T，替代碱基为C；所述Artemia SNP07位于卤虫的contig354上，物理位置为393026，参考碱基为A，替代碱基为G；所述Artemia SNP08位于卤虫的contig498上，物理位置为463045，参考碱基为C，替代碱基为T；所述Artemia SNP09位于卤虫的contig511上，物理位置为1564272，参考碱基为A，替代碱基为G；所述Artemia SNP10位于卤虫的contig676上，物理位置为177489，参考碱基为C，替代碱基为T；所述Artemia SNP11位于卤虫的contig779上，物理位置为1201204，参考碱基为C，替代碱基为T；所述Artemia SNP12位于卤虫的contig2191上，物理位置为107679，参考碱基为A，替代碱基为G；所述Artemia SNP13位于卤虫的contig2877上，物理位置为71092，参考碱基为C，替代碱基为T；所述13个SNP分子标记的物理位置是基于卤虫(Artemiaparthenogenetica)挂载到染色体的contig序列作为参考基因组确定的。 数据由马 克 数 据整理